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Caracterización morfológica y molecular de aislamientos de Monilinia fructicola obtenidos de frutos de durazno [Prunus persica (L.) Batsch] en México y pruebas de agresividad sobre durazno, pera y manzana. Colegio de Postgraduados
Robles Yerena, Leticia.
Existen tres especies de Monilinia reportadas como causantes de la pudrición café de los frutos de hueso: M. fructigena y M. laxa de origen Europeo y M. fructicola de origen Americano. En este trabajo 50 cultivos monospóricos de Monilinia spp. de frutos de durazno provenientes de los Estados de Aguascalientes, Chihuahua, Michoacán, Morelos y Zacatecas, México colectados durante el 2008-2009. La caracterización molecular se hizo mediante PCR e ITS y se confirmó a Monilinia fructicola con base en la banda de 500 pb y la amplificación de la región interna ITS-1 e ITS-2. Para la caracterización morfológica PDA y agar-durazno (AD2) fueron seleccionados. Las colonias fueron color gris marrón, de crecimiento continuo uniforme y los márgenes de las colonias fueron...
Palavras-chave: Monilinia fructigena; Pudrición café; Postcosecha; Medios de cultivo; PCR; Brown rot; Postharvest; Media cultures; Maestría; Fitopatología.
Ano: 2010 URL: http://hdl.handle.net/10521/84
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Detección e incidencia del fitoplasma Maize Bushy Stunt y su relación con el rendimiento en maíz en el Estado de Veracruz, México Colegio de Postgraduados
Alcántara Mendoza, Susana.
Una nueva enfermedad del maíz apareció en el estado de Veracruz, México durante 2003-2004. Síntomas de amarillamiento, enrojecimiento y posterior quemado de hojas, proliferación de mazorcas, jilotes raquíticos, falta de fecundación y granos vanos fueron parte del síndrome de la enfermedad. El fitoplasma Maize Bushy Stunt (MBS) se identifico por PCR se detectó en plantas con los síntomas antes descritos, en los municipios de Tlalixcoyan, Cosoleacaque y Paso de Ovejas en 2006 y 2007. Los genotipos CP-562, 30F83, 30F92, Orca, 30F96, Nutria y Asgrow 7573 resultaron positivos a la presencia del MBS, mientras que en 3086, 30F97 y CP-560 no se detectó la presencia del MBS en una plantación experimental en plantas sintomáticas en Tlalixcoyan, Ver. en 2006 y 2007....
Tipo: Tesis Palavras-chave: Maize Bushy Stunt; PCR; Incidencia; Resistencia genética; Genoma y homología; Maestría; Fitopatología; Maize Bushy Stunt; Incidence; Genetic resistance; Genome and homology..
Ano: 2009 URL: http://hdl.handle.net/10521/1574
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Búsqueda de portainjertos de aguacate tolerantes resistentes a Phytophthora cinnamomi Rands Colegio de Postgraduados
Castañeda González, Elba Lidia.
México se considera el centro de origen del aguacate y mantiene diversidad genética en materiales criollos. En este estudio, se realizaron colectas de semilla para detectar tolerancia o resistencia a Phytophthora cinnamomi Rands, principal patógeno de la raíz del aguacate. El material se colectó en los estados de Querétaro, Puebla y Estado de México, seleccionando árboles que no mostraban síntomas (árboles “escape”) aún cuando los huertos están infestados con el patógeno. Además, se incluyeron en la investigación semillas de 22 accesiones del Banco de Germoplasma (BG) de la Fundación Salvador Sánchez Colín CICTAMEX S.C. y planta clonal del portainjerto Duke-7 resistente a P. cinnamomi y utilizado como testigo. Se inocularon 5,200 plántulas con...
Tipo: Tesis Palavras-chave: Persea americana Mill.; Portainjertos; PCR Persea americana Mill.; Rootstock; PCR.
Ano: 2012 URL: http://hdl.handle.net/10521/1071
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Etiología del variegado del chile (Capsicum annuum L.) en Yurécuaro, Michoacán. Colegio de Postgraduados
Hernández Deheza, María Guadalupe.
En Yurécuaro, Michoacán, en el ciclo de cultivo verano otoño 2009 y 2011 se encontraron en cultivos de chile síntomas de variegado, nervaduras cloróticas, deformación de la lámina foliar y fruto, albinismo y escaldadura, síndrome al cual se le denominó “variegado del chile”. A simple vista, esta serie de síntomas indicaban que el problema era causado por virus fitopatógenos; sin embargo, en ensayos previos se detectó a Candidatus Liberibacter solanacearum, por lo que el objetivo del presente trabajo fue determinar si esta bacteria es el agente causal del variegado del chile. Mediante transmisión por injerto, transmisión con el vector Bactericera cockerelli y reacción en cadena de la polimerasa con el par de iniciadores OA2/CLi.po.F y OI2, se confirmo que...
Palavras-chave: Candidatus Liberibacter; PCR; Secuenciación; Sequencing; Entomología y Acarología; Doctorado.
Ano: 2013 URL: http://hdl.handle.net/10521/1844
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Variantes alélicas del gen de la Kappa-Caseína en ganado criollo lechero tropical. Colegio de Postgraduados
Álvarez Cepeda, Amado Alberto.
Las variantes A y B del gen de la κ-caseína influyen en la producción y composición de la leche y sus derivados. La variante B está relacionada con un mayor rendimiento de la cuajada. El objetivo de este estudio fue determinar las frecuencias genotípicas y alélicas de las variantes A y B del gen de la κ-caseína en la población de hembras Criollo Lechero Tropical y su relación con la composición química de la leche. Se recolectaron muestras de sangre de la vena coccígea de las hembras utilizando tubos Vacutainer de 5 ml adicionados con el anticoagulante EDTA. La extracción de ADN y la amplificación y digestión del gen, se realizó bajo condiciones de laboratorio. Se utilizó la técnica de Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) para amplificar el gen de la...
Palavras-chave: Criollo Lechero Tropical; PCR; RFLP; K-caseína; Tropical Milking Creole; K-casein; Ganadería; Maestría.
Ano: 2014 URL: http://hdl.handle.net/10521/2259
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Determinación de la dieta del jaguar (Panthera onca) y puma (Puma concolor) en el municipio de Tamasopo, San Luis Potosí Colegio de Postgraduados
Rueda Zozaya, Rocío del Pilar.
En México se encuentran los felinos más grandes de América, el puma (Puma concolor) y el jaguar (Panthera onca). Debido al incremento en las fronteras agropecuarias, el jaguar y el puma se encuentran en peligro de extinción en varias áreas de su distribución. Aunada a su situación crítica, su comportamiento elusivo y críptico dificulta aún más la accesibilidad para realizar investigación acerca de su etología, hábitos alimenticios y estimación de parámetros poblacionales. Por ello, se ha tenido la necesidad de recurrir a otros métodos de investigación no invasivos que eviten el manejo directo, uno de estos métodos es la recolección de excretas para identificar los componentes de su dieta, con esta información, se puede evaluar si realmente estos felinos...
Palavras-chave: Panthera onca; Puma concolor; Dieta; PCR; Diet; Ganadería; Fauna silvestre; Maestría.
Ano: 2010 URL: http://hdl.handle.net/10521/76
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Factor 9 de crecimiento y diferenciación asociado al índice de prolificidad en la oveja pelibuey. Colegio de Postgraduados
Pérez Ruíz, Elizabeth.
El Factor 9 de Crecimiento y Diferenciación (GDF9) es miembro de la súperfamilia β de factores de crecimiento (TGFβ) y su expresión en el ovocito es esencial para el desarrollo y crecimiento folicular. Diferentes mutaciones en el gen GDF9 han sido asociadas con el incremento de tasa de ovulación y/o prolificidad en algunas razas de ovejas, por lo que el objetivo de este estudio fue la búsqueda de polimorfismos de una sola base (SNPs) en el gen GDF9, así como la asociación entre polimorfismos del gen GDF9 y el índice de prolificidad en ovejas de la raza Pelibuey. Se tomaron muestras sanguíneas de la vena yugular de 16 ovejas y fueron conservadas en papel FTA® (Whatman Mini Card). El exón dos del gen fue amplificado mediante la técnica de Polimerase Chain...
Palavras-chave: Análisis de secuencias; GDF9; Mutación; Polimorfismo; PCR; SNP; Sequence analysis; Mutation; Polymorphism; Maestría; Ganadería.
Ano: 2012 URL: http://hdl.handle.net/10521/1712
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Variación morfométrica y genética de Diaphorina citri (Hemiptera: Liviidae) en rutáceas de Veracruz, México. Colegio de Postgraduados
Cuellar Sánchez, Valeria Isabel.
Diaphorina citri es el vector más importante del Huanglongbing, la enfermedad más destructiva de los cítricos en el mundo. El objetivo de este estudio fue detectar la presencia de variantes morfométricas y genéticas, a través del análisis de secuencias de nucleótidos mediante RAPDs y el gen mitocondrial mtCOI para determinar si existe correspondencia entre variantes de individuos de D. citri Kuwayama (Hemiptera: Liviidae), colectados en rutáceas de Veracruz, México. Se encontraron variaciones morfométricas en el ancho, largo y venación de las alas y de los procesos genales de los especímenes estudiados. Los análisis genéticos por medio de RAPDs y secuencias obtenidas con el gen mtCOI confirman la existencia de cuatro haplotipos (H1-H4) de D. citri...
Palavras-chave: Psílido asiático de los cítricos; Morfometría; RAPDs; COI; PCR; Asiatic citrus psyllid; Morphometrics; Entomología y Acarología; Maestría.
Ano: 2014 URL: http://hdl.handle.net/10521/2346
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Detección e incidencia del fitoplasma Maize Bushy Stunt y su relación con el rendimiento en maíz en el estado de Veracruz, México Colegio de Postgraduados
Alcántara Mendoza, Susana.
Una nueva enfermedad del maíz apareció en el estado de Veracruz, México durante 2003-2004. Síntomas de amarillamiento, enrojecimiento y posterior quemado de hojas, proliferación de mazorcas, jilotes raquíticos, falta de fecundación y granos vanos fueron parte del síndrome de la enfermedad. El fitoplasma Maize Bushy Stunt (MBS) se identifico por PCR se detectó en plantas con los síntomas antes descritos, en los municipios de Tlalixcoyan, Cosoleacaque y Paso de Ovejas en 2006 y 2007. Los genotipos CP-562, 30F83, 30F92, Orca, 30F96, Nutria y Asgrow 7573 resultaron positivos a la presencia del MBS, mientras que en 3086, 30F97 y CP-560 no se detectó la presencia del MBS en una plantación experimental en plantas sintomáticas en Tlalixcoyan, Ver. en 2006 y 2007....
Palavras-chave: Maize Bushy Stunt; PCR; Incidencia; Resistencia genética; Genoma; Homología; Incidence; Genetic resistance; Genome; Homology; Maestría en Ciencias; Postgrado en Fitosanidad; Fitopatología.
Ano: 2009 URL: http://hdl.handle.net/10521/53
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Antracnosis del fruto de litchi (Litchi chinensis Soon.) : etiología y control in vitro. Colegio de Postgraduados
Martínez Bolaños, Misael.
El litchi (Litchi chinensis Soon) es un fruto subtropical. El cultivar Brewster se explota comercialmente en la región del Papaloapan y el cv. Mauritius en los Bajos Mixes, Oaxaca, México. El manchado del pericarpio es uno de los problemas principales en pre y postcosecha del fruto en ambos cultivares. No se han encontrado registros de su causa o importancia en México, por ello los objetivos de esta investigación fueron: determinar la etiología del manchado café del pericarpio e iniciar la exploración del control in vitro de su agente causal. La antracnosis o manchado del pericarpio del litchi se caracterizó externa e internamente por lesiones circulares de color café, con márgenes bien definidos en el pericarpio, pero sin afectar el arilo o la semilla....
Palavras-chave: Brewster; Mauritus; Pathogenicity; Incidence; PCR; Patogenicidad; Incidencia; Antracnosis; Benomil; Procloraz; Hidróxido de cobre; Doctorado; Fitopatología.
Ano: 2012 URL: http://hdl.handle.net/10521/1701
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Determinación de la dieta del jaguar (Panthera onca) y puma (Puma concolor) en el municipio de Tamasopo, San Luis Potosí Colegio de Postgraduados
Rueda Zozaya, Rocío del Pilar.
En México se encuentran los felinos más grandes de América, el puma (Puma concolor) y el jaguar (Panthera onca). Debido al incremento en las fronteras agropecuarias, el jaguar y el puma se encuentran en peligro de extinción en varias áreas de su distribución. Aunada a su situación crítica, su comportamiento elusivo y críptico dificulta aún más la accesibilidad para realizar investigación acerca de su etología, hábitos alimenticios y estimación de parámetros poblacionales. Por ello, se ha tenido la necesidad de recurrir a otros métodos de investigación no invasivos que eviten el manejo directo, uno de estos métodos es la recolección de excretas para identificar los componentes de su dieta, con esta información, se puede evaluar si realmente estos felinos...
Palavras-chave: Panthera onca; Puma concolor; Dieta; PCR; Diet; Ganadería; Fauna silvestre; Maestría.
Ano: 2010 URL: http://hdl.handle.net/10521/76
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Búsqueda de portainjertos de aguacate tolerantes resistentes a Phytophthora cinnamomi Rands Colegio de Postgraduados
Castañeda González, Elba Lidia.
México se considera el centro de origen del aguacate y mantiene diversidad genética en materiales criollos. En este estudio, se realizaron colectas de semilla para detectar tolerancia o resistencia a Phytophthora cinnamomi Rands, principal patógeno de la raíz del aguacate. El material se colectó en los estados de Querétaro, Puebla y Estado de México, seleccionando árboles que no mostraban síntomas (árboles “escape”) aún cuando los huertos están infestados con el patógeno. Además, se incluyeron en la investigación semillas de 22 accesiones del Banco de Germoplasma (BG) de la Fundación Salvador Sánchez Colín CICTAMEX S.C. y planta clonal del portainjerto Duke-7 resistente a P. cinnamomi y utilizado como testigo. Se inocularon 5,200 plántulas con...
Tipo: Tesis Palavras-chave: Persea americana Mill.; Portainjertos; PCR; Doctorado; Fitopatología; Rootstock.
Ano: 2009 URL: http://hdl.handle.net/10521/1334
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Identificación filogenética de Candidatus Liberibacter solanacearum y su efecto en la calidad fisiológica de la semilla de chile jalapeño. Colegio de Postgraduados
Olivares Mercado, Perla Xochitl.
En 1993 se reportó por primera vez en México a Candidatus Liberibacter solanacearum, como el agente causal de la pigmentación morada en las hojas, reducción de tamaño de la planta y necrosis interna de los tubérculos de la papa; posteriormente se detectó este bacterium en los cultivos de tomate, chile y berenjena. Sin embargo, la distribución de las plantas sintomáticas en el campo no tenía un patrón definido hasta que en 2009 se observó la totalidad de plantas atípicas de chile jalapeño cv Ixtapa en dos campos de los estados de Nayarit y Jalisco. Las plantas tuvieron una reducción de tamaño en un 30%, hojas con coloración verde pálido y deformación de los frutos en un 100%. Por tal razón la presente investigación tuvo como objetivos identificar el agente...
Palavras-chave: Chile jalapeño; Candidatus Liberibacter solanacearum; PCR; Clonación; Microscopia electrónica de barrido; Calidad de la semilla; Jalapeño pepper; Cloning; Electronic microscopy scanning; Seed quality; Producción de Semillas; Maestría.
Ano: 2013 URL: http://hdl.handle.net/10521/1956
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Detección e incidencia del fitoplasma Maize Bushy Stunt y su relación con el rendimiento en maíz en el estado de Veracruz, México Colegio de Postgraduados
Alcántara Mendoza, Susana.
Una nueva enfermedad del maíz apareció en el estado de Veracruz, México durante 2003-2004. Síntomas de amarillamiento, enrojecimiento y posterior quemado de hojas, proliferación de mazorcas, jilotes raquíticos, falta de fecundación y granos vanos fueron parte del síndrome de la enfermedad. El fitoplasma Maize Bushy Stunt (MBS) se identifico por PCR se detectó en plantas con los síntomas antes descritos, en los municipios de Tlalixcoyan, Cosoleacaque y Paso de Ovejas en 2006 y 2007. Los genotipos CP-562, 30F83, 30F92, Orca, 30F96, Nutria y Asgrow 7573 resultaron positivos a la presencia del MBS, mientras que en 3086, 30F97 y CP-560 no se detectó la presencia del MBS en una plantación experimental en plantas sintomáticas en Tlalixcoyan, Ver. en 2006 y 2007....
Palavras-chave: Maize Bushy Stunt; PCR; Incidencia; Resistencia genética; Genoma; Homología; Incidence; Genetic resistance; Genome; Homology; Maestría; Postgrado en Fitosanidad; Fitopatología.
Ano: 2009 URL: http://hdl.handle.net/10521/53
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Caracterización morfológica y molecular de aislamientos de Monilinia fructicola obtenidos de frutos de durazno [Prunus persica (L.) Batsch] en México y pruebas de agresividad sobre durazno, pera y manzana. Colegio de Postgraduados
Robles Yerena, Leticia.
Existen tres especies de Monilinia reportadas como causantes de la pudrición café de los frutos de hueso: M. fructigena y M. laxa de origen Europeo y M. fructicola de origen Americano. En este trabajo 50 cultivos monospóricos de Monilinia spp. de frutos de durazno provenientes de los Estados de Aguascalientes, Chihuahua, Michoacán, Morelos y Zacatecas, México colectados durante el 2008-2009. La caracterización molecular se hizo mediante PCR e ITS y se confirmó a Monilinia fructicola con base en la banda de 500 pb y la amplificación de la región interna ITS-1 e ITS-2. Para la caracterización morfológica PDA y agar-durazno (AD2) fueron seleccionados. Las colonias fueron color gris marrón, de crecimiento continuo uniforme y los márgenes de las colonias fueron...
Palavras-chave: Monilinia fructigena; Pudrición café; Postcosecha; Medios de cultivo; PCR; Brown rot; Postharvest; Media cultures; Maestría; Fitopatología.
Ano: 2010 URL: http://hdl.handle.net/10521/84
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Estandarización y validación de la técnica de PCR para el diagnóstico de Salmonella typhimurium en carne de cerdo, res y pollo. Colegio de Postgraduados
Rosas Espejel, Monzerrat.
El estudio tuvo como objetivo estandarizar y validar la técnica de Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) para la detección de Salmonella typhimurium (St) en carne de cerdo, res y pollo, optimizando el tiempo y la sensibilidad con relación al método microbiológico; además se realizó el diagnóstico en estos tipos de carnes para evaluar su calidad microbiológica en la Ciudad de Texcoco. Un total de 60 muestras de carne (20 de cerdo, 20 de res y 20 de pollo) de 250 g fueron recolectadas en puntos de venta de la Ciudad de Texcoco. Las muestras recolectadas procedían de carnicerías, tianguis y supermercados. Se evaluó la sensibilidad y especificidad de la PCR para detectar St; asimismo, se validó esta técnica en relación al método microbiológico con base al...
Palavras-chave: Salmonella typhimurium; PCR; Carne; Validación; Meat; Validation; Ganadería; Maestría.
Ano: 2014 URL: http://hdl.handle.net/10521/2388
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A simple ethanol wash of the tissue homogenates recovers high-quality genomic DNA from Corchorus species characterized by highly acidic and proteinaceous mucilages Electron. J. Biotechnol.
Kundu,Avijit; Sarkar,Debabrata; Bhattacharjee,Amit; Topdar,Niladri; Sinha,Mohit Kumar; Mahapatra,Bikash Sinha.
A simple miniprep based on early elimination of highly acidic and proteinaceous mucilages through ethanol washing of the tissue homogenates has been developed for the extraction of genomic DNA from mature leaves and seeds of Corchorus spp. As compared to high cetyltrimethylammonium bromide (CTAB)-NaCl DNA extraction followed by ethanol-based removal of remnant mucilages from the DNA pellet, this simple miniprep consistently and reproducibly recovers high amounts of DNA with good spectral qualities at A260/A280 and A260/A230. The purified DNA is efficiently digested by restriction endonucleases, and is suitable for PCR amplification of nuclear microsatellites with expected allele sizes.
Tipo: Journal article Palavras-chave: Corchorus; DNA extraction; Microsatellite; Mucilage; PCR; Restriction digestion.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582011000100010
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LaNe RAGE: a new tool for genomic DNA flanking sequence determination Electron. J. Biotechnol.
Park,Daniel J.
The determination of genomic DNA sequence flanking a known region is often problematic. Existing technologies depend on multiple, efficient enzyme-catalysed preparative processing steps and/or rely on relatively inefficient ‘one-sided' PCR mechanisms. I demonstrate the application of a simple ‘two-sided' PCR-based approach, lariat-dependent nested PCR for rapid amplification of genomic DNA ends (LaNe RAGE), applied to the mouse GAPDH and PGK1 gene flanking sequences. This demonstration offers great promise in applications such as genome walking, transposon mutagenesis mapping and DNA fingerprinting
Tipo: Journal article Palavras-chave: Cloning; DNA fingerprinting; Genomic DNA walking; PCR; Sequencing; Transposon mutagenesis.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582005000200012
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Bt protein rhizosecreted from transgenic maize does not accumulate in soil Electron. J. Biotechnol.
Margarit,Ezequiel; Reggiardo,Martín I; Permingeat,Hugo R.
The persistence of CryIAb protein rhizosecreted in soil is important in the assessment of its environmental risk. Here we report that CryIAb protein from transgenic maize does not accumulate at high levels in soils. Levels of CryIAb protein rhizosecreted by three maize transgenic events (BT11, MON810 and 176) were studied in hydroponic cultures and found only in the MON810 and BT11 events but not in event 176 or control plants. Under field conditions, the cryIAb gene and a basal level of CryIAb protein was detected in soils from plots cultivated with transgenic and non-transgenic maize, possibly from Bacillus thuringiensis present in the soils.
Tipo: Journal article Palavras-chave: CryIAb gene; CryIAb protein; ELISA; Genetically modified organisms; PCR; Zea mays (L.).
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582008000200004
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Novel protocol to identify true hybrids in normal oleate x high oleate crosses in peanut Electron. J. Biotechnol.
Wang,Chuan Tang; Yu,Shan Lin; Zhang,Shu Wei; Wang,Xiu Zhen; Tang,Yue Yi; Zhang,Jian Cheng; Chen,Dian Xu.
A novel hybrid identification protocol was developed for F0:1 peanut seeds resulting from crosses between normal oleate cultivars with wild type FAD2B gene and high oleate genotypes with an A insertion in FAD2B gene. Presence of a series of overlapped peaks in trace file of the PCR product amplified with bF19/R1 primers was an indication of hybridity. This protocol may facilitate high oleate breeding and genetic studies in peanut.
Tipo: Journal article Palavras-chave: Identification; NIRS; PCR; Peanut; True hybrid.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582010000500018
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